膽道蛔蟲病的危險性在于它可以引發較多的嚴重的并發癥。這些并發癥可達10余種，其中肝膿腫為首位，其余尚有膽管和膽囊化膿性炎癥、膽道出血、膽道穿孔、急性胰腺炎、中毒性休克、慢性膽囊炎、膽道結石、肝硬化等。
1.肝膿腫 膽道蛔蟲進入肝內膽管或其所帶細菌上行感染可形成肝內膽管炎，炎癥進一步發展穿透膽管形成膿腫，蛔蟲死亡后的蟲體溶組織毒素加速肝膿腫的形成和發展。臨床表現與其他原因的肝膿腫相似，有肝區疼痛、寒戰高熱、肝臟腫大、肝區壓痛和叩擊痛、白細胞計數增高等。肝膿腫內有蛔蟲時可向腹腔穿破形成化膿性腹膜炎，或向膈肌穿破形成膽管氣管瘺，蛔蟲可進入胸腔或由氣管排出體外。
2.膽管炎和膽囊炎 腸道致病菌被蛔蟲帶入膽道，可誘發急性化膿性膽管炎和膽囊炎，除了膽道蛔蟲病的陣發性絞痛外，尚可有持續性脹痛、寒戰高熱、黃疸、精神癥狀及中毒性休克表現。若非急性化膿性感染，可遷延發展形成慢性膽管炎及膽囊炎。
3.急性胰腺炎 蛔蟲進入十二指腸乳頭，Oddi括約肌痙攣、水腫，膽汁胰液排出受阻，感染性膽汁逆流可激活胰酶誘發急性胰腺炎。輕者胰腺水腫，重者胰腺出血壞死等。少數病例因蛔蟲直接進入胰管引起梗阻、細菌感染、急性胰腺炎發生。
4.膽道出血 膽管炎的發生機制和蛔蟲的機械損傷均可引起。膽管炎累及肝臟匯管區時，該處肝動脈和門靜脈分支血管壁因感染而變得脆弱，炎癥侵蝕和蛔蟲運動可導致破裂，出血流入膽道。膽道出血發生前常有寒戰高熱等膽道感染癥狀，右上腹絞痛，隨后嘔血或伴有黑便。出血量多血壓明顯下降時可自凝，血壓逐漸恢復正常。但感染未控制可再次導致出血，故膽道出血可呈周期性反復發生，間隔一般為1～2周。
5.膽道結石 膽道內蛔蟲尸體腐敗碎片可隨膽汁排出，但其角皮所含角質較多不易腐壞，加上蛔蟲卵沉積在膽道系統，可作為成石核心，與其他成石因素共同作用，導致膽色素、膽固醇沉著，形成肝內外膽管結石、膽囊結石。多數報告表明了膽石核心為蛔蟲碎片或蛔蟲卵者占有相當的比例。也有學者將蛔蟲或蟲卵置入犬的膽管、膽囊內，發現其表面形成膽色素或鈣鹽沉積，易于發生結石。膽道結石形成后，可呈發作性Charcot三聯征，或單純出現無痛性黃疸。
