中國科學院大學重慶醫院(重慶市人民醫院)是重慶市首批三級甲等綜合性醫院。經重慶市政府批準，由原重慶市第三人民醫院、重慶市中山醫院合并組建，于2016年3月25日掛牌成立。2018年6月12日，在重慶市委市政府、市衛生健康委的支持下，與中國科學院大學簽約共建中國科學院大學重慶醫院（保留重慶市人民醫院編制），成為中國科學院大學直屬附屬醫院。2018年11月18日，依托醫院成立了中國科學院大學重慶臨床醫學院。醫院是重慶市首家涉外醫院、重慶市干部保健醫院、重慶市廳局級領導干部定點體檢單位，曾多次圓滿完成國內外領導人、大型會議和賽事的醫療保健工作。

醫院學科門類齊全、優勢學科集聚。擁有國家神經系統疾病臨床醫學研究中心重慶分中心、重慶市心肺血管疾病醫療研究所、重慶市老年病防治研究所、重慶市骨傷骨病醫療中心、重慶市臨床檢驗中心、重慶市眼耳鼻咽喉科醫院、重慶市博士后科研工作站等，為持續提升醫療服務能力和醫學學科發展提供了堅實基礎。醫院現有臨床醫技科室56個，擁有1項國家疑難病癥診治能力提升工程項目（心血管外科），1個國家臨床重點?？疲ㄟ^敏反應科），5個重慶市醫學重點學科（心血管外科、骨科、老年病學科、耳鼻咽喉科學、醫學檢驗科），14個重慶市臨床重點專科（重癥醫學科、檢驗科、麻醉科、呼吸內科、骨科、老年病科、醫學影像科、神經外科、消化內科、神經內科、心血管內科、普通外科、心胸外科、腫瘤科），1個重慶市特色醫學?？疲祻歪t學科），4個臨床研究中心（心血管外科學、檢驗醫學、耳鼻咽喉學、老年疾病學），5個國家及重慶市重點實驗室（國家發改委血管植入物工程實驗室、腎臟病透析治療研究室、臨床檢驗質量控制研究室、結核基因診斷中心實驗室、神經變性病實驗室）。醫院形成了以心血管外科、耳鼻咽喉頭頸外科、骨科、肝膽胰腺外科、乳腺甲狀腺外科、老年病科、醫學檢驗科為主的具有重要影響力的學科群。

醫院高端人才匯集、專業實力雄厚。現有職工2500余人，其中專業技術人員2100余人，雙聘院士1人，高級職稱近400人，博士70余人，擁有一批國務院政府特殊津貼專家、重慶市突出貢獻專家、市級學術技術帶頭人以及博士、碩士研究生兼職導師，是國家住院醫師規范化培訓基地、國家臨床藥師規范化培訓基地、國家藥物及醫療器械臨床試驗機構、重慶市護士規范化培訓基地。

重慶市人民醫院三院院區前身是1929年創立的國民政府中央醫院，1939年遷至重慶。1945年在學田灣設立國民政府中央醫院城區門診部，1947年該門診部遷至現址，更名為國民政府中央醫院重慶城區分院，1950年后相繼整編為西南軍政委員會、西南行政委員會直屬醫院。1951年負責西南局機關干部醫療保健工作，1954年設置全市唯一一家地專級以上高級干部病房（直至20世紀80年代），1955年正式命名為重慶市第三人民醫院。1985年成為重慶市唯一的副廳級醫院，1991年增掛重慶市老年病防治研究所，1993年成為全市首批三級甲等醫院，1997年增掛重慶市臨床檢驗中心，2003年增掛重慶市眼耳鼻咽喉科醫院，2006年增掛重慶中俄友好醫院。

重慶市人民醫院中山院區前身是1935年創立的重慶義林醫院，位于重慶市渝中區中山一路。1950年命名為重慶市第二人民醫院。1961年按中央衛生工作會議決定進行學科調整，組建成全國唯一的外科醫院即重慶市外科醫院，同期建成中國第一個肝膽外科臨床科室。1995年增掛重慶市心肺血管疾病醫療研究中心，1996年增掛重慶市骨傷骨病醫療研究中心，2001年更名重慶市中山醫院。2012年與重慶市肺科醫院合并組建重慶市中山醫院。

重慶市人民醫院江北院區前身是重慶市肺科醫院，創建于1956年，以呼吸疾病尤其是結核病防治為主，是西南地區較大的治療各種肺部疾病和重慶市指定治療結核病?？漆t院。醫院曾用名為重慶市江北干部療養院，后更名為重慶市第二結核病醫院，1984年被市政府正式定名為重慶市肺科醫院。1996年經市政府批準，增掛重慶市第十二人民醫院牌子。2012年與原重慶市中山醫院正式合并成立重慶市中山醫院。2019年12月27日，江北院區停診。