一、檢查：
1.血和尿核黃素濃度測定 血核黃含量和24h尿排泄核黃素量測定，正常人血液內含核黃素50μg，24h內尿排泄量為0.5～1.0mg，核黃素缺乏時血液水平和尿排泄量減低。但直接測血及尿中核黃素濃度或排出量不能真實反映體內核黃素缺乏情況。
2.細胞中維生素B2含量測定 細胞中維生素B2含量是評定維生素B2營養水平的良好指標，含量<140μg/L為缺乏，>200μg/L為良好。
3.負荷試驗 口服5mg維生素B2后，4h尿液中排出維生素B2量<350μg為不足。
4.尿肌酸酐內核黃素測定 排出的每克肌酸酐內核黃素<30μg時，可伴隨產生核黃素缺乏的臨床體征。
5.維生素B2肌酐比值 維生素B2肌酐比值<27μg/g為不足，27～79μg/g為低下，80～269μg/g為適宜，>270μg/g為充裕。
6.紅細胞谷胱甘肽還原酶(EGR) 紅細胞谷胱甘肽還原酶(EGR)活性(Activation coefficient，AC)測定，AC是目前公認的專一性檢測體內核黃素有無缺乏的方法。此系數代表紅細胞對FAD的飽和程度。正常AC值為0.2～1.2，檢測時加入FAD后AC值升高由核黃素引起的紅細胞谷胱甘肽還原酶活性增強，是核黃素缺乏的早期體征，AC>1.2表示組織中維生素B2不足。此法不適用于G-6PD患者，因為此時紅細胞對FAD的需要量顯著增加。
骨髓檢查可發現有紅骨髓發育不全，并因此引起再生障礙性貧血的發生。
