急性期時可有急性炎癥的發現，如血白細胞數升高，中性粒細胞的有百分比增高，下列檢查對診斷更有重要意義。
(一)尿常規檢查是最簡便而可靠的檢測泌尿道感染的方法。宜留清晨第一次尿液待測，凡每個高倍視野下超過5個(>5個/Hp)白細胞稱為膿尿。現用試紙法檢測白血球，簡稱尿入聯，機理是白細胞中含有酯酶，可產生哚酚與試紙中的重氮鹽產生紫色反應，當白細胞超過10個/ml時呈陽性反應，但甲醛等防腐劑可造成假陽性反應。試紙中應用Griess硝酸鹽還原試驗，即腸道細菌能將尿中的硝酸鹽還原成亞硝酸鹽而使試紙顯色(粉紅色)，革蘭陽性性菌和假單胞菌對此不敏感，大量維生素C可呈假陽性反應，患者宜在服用此藥后至少10小時以上收集尿標本。急性泌尿道感染時除有膿尿外，常可發現白細胞管型，菌尿，有時可伴顯微鏡下血尿或肉眼血尿，尤其是布魚蝦桿菌、奴卡桿菌及放線菌(包括結核桿菌)感染時。偶見微量蛋白尿，如有較多蛋白尿則提示腎小球受累及。
(二)尿細胞學檢查以往認為清潔中段尿培養菌落計數大于105/ml有臨床意義，小于104/ml為污染所致，現大量事實證明約92%革蘭氏陰性細菌引起的尿路感染菌落計數大于105/ml，僅70%左右的革蘭陽性菌引起的尿路感染菌計數超過105/ml，而20%～30%的患者其菌計數僅有103～105/ml，尤其是大多數下尿路感染乾。菌落計數不高的原因有：尿頻尿急等刺激癥狀明顯使尿液在膀胱內逗留的時間太短暫不利于細菌的繁殖;抗菌藥物的治療;快速利尿;特別酸化的尿不利于細菌生長繁殖;尿路梗阻;腔外感染;或是厭氧菌等需要特殊培養基的細菌感染。革蘭陽性細菌分裂慢，且有疑集傾向，故菌落葉計數往往偏低，因此有臨床癥狀者菌落計數在103～104/ml也需考慮感染存在。
(三)無創傷性感染的定位檢查
1.尿濃縮能力 理論上急慢性腎盂腎常伴腎小管濃縮功能的障礙。
2.尿酶的測定 有報道腎盂腎炎者約有25%的患者尿中乳酸脫氫酶(LDH)高于下尿路感染者。腎盂腎炎時尿中的N-乙酰-β-D氨基葡萄糖苷酶高于下尿路感染者，因此酶存在于腎小管的上皮細胞內，迄今能作為泌尿道感染的定位診斷的尿酶仍在研究中。
3.尿C反應蛋白測定文獻報道血清C反應蛋白在影響到腎實質的上尿路感染時間顯增高，病程中隔日隨C反應蛋白(CRP)水平有助于估計療效，即CRP一目了然示有效，上升示無效。急性膀胱炎時CRP并不升高。但其他感染性疾病時CRP也可能升高，以及假陽性的存在影響了該試驗的定位意義。
4.尿抗體包裹細菌分析 用免疫熒光分析證實來自腎臟的細菌包裹著抗體，可和熒光標記的抗體IgG結合呈陽性反應來自膀胱的細菌不被特異性的抗體所包裹，故近年來尿液抗體包裹性細菌(ACB)分析較廣泛地用于上下尿路感染的定位診斷。其準確性約83%。但某些前列腺炎、膀胱炎及大量蛋白尿可出現假陽性。
另外尿β2微球蛋白測定也有助于鑒別上、下尿路感染，上尿路感染易影響腎小管對分子蛋白質的再吸收，尿β2微球蛋白升高，而下尿路感染尿β2微球蛋白不會升高。
5.直接定位法 直接法中，Stamey的輸尿管導管法準確性較高，但必須通過膀胱鏡檢查或用Skinny針經皮穿刺腎盂取尿，故為創傷性檢查法而不常用，Fairley的膀胱沖洗滅菌后尿培養法準確度大于90%，且簡便易行，臨床常用。具體方法為從導管中注入0.2%新霉素溶液40ml使膀胱滅菌，再以鹽水沖洗，然后收集流入膀胱內的尿液作培養，每10分鐘取尿標本一次，連續3次。如為膀胱炎，經上法滅菌后細菌培養應為陰性;如為腎盂腎炎，則仍為陽性，且菌落數遞次上升。
(四)X線檢查由于急性泌尿道感染本身容易產生膀胱輸尿管返流，故靜脈或逆行腎盂造影宜在感染消除后4～8周后進行，急性腎盂腎炎以及無并發癥的復發性泌尿道感染并不主張常規做腎盂造影。對慢性或久治不愈患者，視需要分別可作尿路平片、靜脈腎盂造影、逆行腎盂造影、排尿時膀胱輸尿管造影，以檢查有無梗阻、結石、輸悄管狹窄或受壓、腎下垂、泌尿系先天性畸形以及膀光輸管返流現象等。此外，還可了解腎盂、腎盞形成及功能，代藉以與腎結核、腎腫瘤等鑒別。慢性腎盂腎炎的腎盂呈輕度擴張或杵核，并可有瘢痕性畸形。腎功能不全時需用2倍或3倍正常劑量碘造影劑作靜脈快速滴入，并多次攝片才能使造影得到滿意效果。腎血管造影可顯示慢性腎盂腎炎的血小管有不同程度的扭曲。必要時可作腎CT掃描或核磁共振掃描，以排隊其他腎臟疾患。
(五)同位素腎圖檢查可了解分腎功能、尿路梗阻、膀胱輸尿管返流及膀胱殘余尿情況。急性腎盂腎炎的腎圖特點為高峰后移，分泌段出現較正常延緩0.5～1.0分鐘，排泄段下降緩慢;慢性腎盂腎炎分泌段斜率降低，峰頂變鈍或增寬而后移，排泄段起始時間延遲。但上述改變并無明顯特異性。
(六)超聲波檢查是目前應用最廣泛，最簡便的方法，它能篩選泌尿道發育不全、先天性畸形、多囊腎、腎動脈狹窄所致的腎臟大小不勻、結石、腎盂積水、腫瘤及前列腺疾病等。
