肺結核需要與以下幾種疾病進行鑒別：
1. 肺炎：各種肺炎因病原體不同而臨床特點各異，但大都起病急，伴有發熱、咳嗽、咳痰明顯，血白細胞和中性粒細胞增高。胸片表現密度較淡且較均勻的片狀或斑片狀陰影，抗菌治療后體溫迅速下降，1-2周左右陰影有明顯吸收。
2. 慢性阻塞性肺疾病：多表現為慢性咳嗽、咳痰，少有咯血。冬季多發，急性加重期可以有發熱。肺功能檢查為阻塞性通氣功能障礙。胸部影像學檢查有助于鑒別診斷。
3. 支氣管擴張：慢性反復咳嗽、咳痰，多有大量膿痰，常反復咯血。輕者X線胸片無異常或僅見肺紋理增粗，典型者可見卷發樣改變，CT特別是高分辨CT能發現支氣管腔擴大，可確診。
4. 肺癌：肺癌多有長期吸煙史，表現為刺激性咳嗽、痰中帶血、胸痛和消瘦等癥狀。胸部X線或CT表現肺癌腫塊常呈分葉狀，有毛刺、切跡。癌組織壞死液化后，可以形成偏心厚壁空洞。多次痰脫落細胞和結核分枝桿菌檢查和病灶活體組織檢查是鑒別的重要方法。
5. 肺膿腫：多有高熱、咳大量膿臭痰。胸片表現為帶有液平面的空洞伴周圍濃密的炎性陰影。血白細胞和中性粒細胞增高。
6. 縱隔和肺門疾病：原發型肺結核應與縱隔和肺門疾病相鑒別。小兒胸腺在嬰幼兒時期多見，胸內甲狀腺多發生于右上縱隔，淋巴系統腫瘤多位于中縱隔，多見于青年人，癥狀多，結核菌素試驗可呈陰性或弱陽性。皮樣囊腫和畸胎瘤多呈邊緣清晰的囊狀陰影，多發生于前縱隔。
7. 其他疾病：肺結核常有不同類型的發熱，需與傷寒、敗血癥、白血病等發熱性疾病鑒別。
8. 慢性支氣管炎：常與慢纖洞患者癥狀相似，但X線與痰菌檢查易于鑒別。慢支患者X線僅見紋理改變未見實質TB灶，而慢纖洞者有明確嚴重病變，且TB（+）。
9. 支氣管擴張：癥狀為咳嗽、咳膿痰、反復咯血，易與慢纖洞相混，但X線一般僅見紋理粗亂或卷發影。
