一、病因
本病病因尚不十分明了。
有人認為是小兒生長發育期植物神經功能尚不穩定，出現迷走神經亢進癥狀，使胃腸平滑肌痙攣產生腹痛。
有人認為本病小兒的痛閾值較正常人低，故對疼痛的敏感性增高。
國外學者注意到功能性復發性腹痛的主要原因是“心理狀態不協調”，在個性測驗中，腹痛兒童的“內向”分顯著偏高，其發生腹痛多與激動、懲罰和家庭糾紛等心理因素有關。
國內學者也強調家長的生活方式、行為習慣對兒童個性、心理的形成及疾病的發生都起著重要的作用。
誘發腹痛的病因很多，大致可分清癥狀性、消化道功能性與器質性三種。
1、癥狀性：
多為腸道外疾病引起，如上呼吸道感染，化膿性扁桃體炎，肝、膽疾病，泌尿系疾病，腸道寄生蟲病均可引起腹痛。
腸寄生蟲病在既往曾是腹痛的最常見病因，近年來由于飲食衛生的改善，腸寄生蟲病已明顯減少，尤其在城市。
2、腹腔內器質性疾病：
如潰瘍病，闌尾炎，腸梗阻，腸穿孔、脾臟破裂、急腹癥等。
3、功能性：
反復突然發作的陣發性腹痛，疼痛部位多在臍周，程度輕重不一，重時可影響飲食及正常學習和生活，可出現哭鬧不止、翻滾，甚至面色蒼白、手足發涼、惡心、嘔吐等癥狀，但發作間歇無異常體征。
最多見的病因是飲食不當、亂吃零食，過食冷飲，便秘，消化功能紊亂引起的腹痛(亦稱功能性消化不良)。
4、其他：
(1)精神性：
國外亦有報告認為與小兒心理因素障礙有關，如緊張、壓抑等。
(2)慢性胃炎及幽門螺桿菌感染：
近年來的研究認為再發性腹痛與慢性胃炎及幽門螺桿菌感染有關。
二、發病機制：
消化功能紊亂引起的腸痙攣的機制為不消化的食物在腸腔內發酵、產氣刺激腸壁，或副交感神經興奮，引起一過性腸壁肌肉痙攣，暫時阻斷腸內容物的通過，于是近端腸管發生強力的收縮及蠕動的紊亂，隨著蠕動的加強，腹痛陣發性加重。
經過一定時間的痙攣后，腸壁肌肉自然松弛，腹痛暫時緩解，以后又可再次發作。
腹腔器官本身痛覺并不敏感。腹痛的發生大體上可有3種形式：
1、絞痛：
多由管狀器官的肌肉痙攣或梗阻(同時伴痙攣)引起，如腸管、膽管及輸尿管痙攣或梗阻，多表現為陣發性絞痛。
2、鈍痛 ：
由器官被膜受牽扯引起，如肝、腎、闌尾及腹膜等炎癥腫脹所引起的被膜牽扯，多表現為持續性鈍痛。疼痛部位多與器官病變所在的部位一致。
3、遷移性痛：
內臟疼痛通過內臟感覺神經傳入相應的脊髓段，使進入相同節段的體神經支配部位感覺疼痛，如肝、膽病的疼痛有時可放射到右肩。
此外，腹部以外的器官疼痛有時也可放射到腹部，如大葉肺炎，帶狀皰疹侵犯腹部脊神經時都可出現較重的腹痛。破傷風的腹肌痙攣也可致劇烈的腹痛。
