(一)發病原因
大便失禁的病因繁多，1種或多種病因均能引起大便失禁。大便失禁的分類方法有多種，可按失禁的程度、性質、直腸感覺和病因等分類，也可以中醫辨證分型，但目前尚無統一的分類標準，其病因分類如下：
1.大便性狀的改變
(1)腸易激綜合征。
(2)炎癥性腸病。
(3)感染性腹瀉。
(4)濫用瀉劑。
(5)吸收不良綜合征。
(6)短腸綜合征。
(7)放射性腸炎。
2.腸容量或順應性異常
(1)炎癥性腸病。
(2)直腸容量缺損。
(3)直腸缺血。
(4)膠原血管性疾病。
(5)直腸腫瘤。
(6)直腸外壓迫。
3.直腸感覺異常
(1)神經系病變。
(2)溢出性失禁。
4.括約肌或盆底功能異常
(1)括約肌解剖學缺損。
(2)盆底肌喪失神經支配。
(3)先天性異常。
老年人大便失禁的原因可能是由于糞塊嵌塞、直腸感覺異常、肛門括約肌壓力降低、神經肌肉功能紊亂、癡呆、醫源性的等等。
(二)發病機制
正常排便活動在是神經內分泌調節下條件反射的隨意活動，是多系統參加的復雜生理過程。結腸內糞便或氣體，隨著結腸節律性收縮運動和胃結腸反射的不自主活動到達直腸下段后，刺激直腸壁壓力感受器。當腔內壓達到一定閾值時，交感神經興奮，直腸擴張、內括約肌收縮，肛隱窩受到刺激而產生便意。這一沖動沿內臟傳入神經骶副交感神經傳入腰髓的排糞中樞，再傳入大腦皮質感覺區和運動區。當大腦皮質解除排便的抑制時，外括約肌和恥骨直腸肌松弛，即可出現排便活動。
關于大便失禁的機制，目前尚不完全清楚。正常大便的自控有賴于許多因素：大腦的功能、糞便的容量和稠度、結腸的傳輸、直腸的膨脹性、肛門括約肌的功能、肛門直腸的敏感性和肛門直腸反射等。這些因素中任何1個或多個因素的異常都可能導致大便失禁。
正常的排便需要適當的肛門直腸感覺。盆底感受器在察覺直腸內存在糞便方面被認為是非常重要的。糞塊嵌塞和溢出性大便失禁患者均有直腸感覺的降低，外傷性和特發性大便失禁(idiopathic fecal incontinence)的患者可能有肛管感覺的異常。特發性大便失禁或稱神經源性大便失禁，它是由于控制盆底橫紋肌及肛門外括約肌的神經進行性損害及內括約肌功能減退所致。
